Ya desde el Paleolítico se tiene conocimiento de núcleos habitados en la zona que actualmente ocupa el término municipal. Durante la Edad Media, Llagostera –sólo configurada por el casco antiguo, rodeado por la muralla– se convirtió baronía en 1375.
A inicios del siglo XIX, Llagostera se convirtió en una de las villas con una fuerte actividad de industria surotapera, junto con la vecina Cassá de la Selva. esta industria significó un crecimiento demográfico y urbanístico de la población, al tiempo que veía nacer una incipiente clase obrera. Es por ello que en 1872 se constituyó una federación local de la Federación Regional Española de la Asociación Internacional de Trabajadores, encabezada por la sindicalista llagosterana Isabel Vilà i Pujol. Después de la Guerra Civil Española, con el declive de la industria surotapera y la falta de una red de agua potable, llegó la parálisis económica del municipio, que no consiguió reorientarse hacia ninguna otra actividad económica. Es una situación que aún persiste actualmente, aunque Llagostera ha recibido nuevas oleadas migratorias, desde el Magreb y el África negra.
